EMCS-hankkeen tarkoituksena on tietokoneistaa väliaikaisesti valmisteverottomana liikkuvien alkoholituotteiden, tupakkatuotteiden ja energiatuotteiden valvonta muuttamalla hallinnollinen saateasiakirja (AAD, Administrative Accompanying Document) sähköiseen muotoon. EMCS tulee sanoista Excise Movement and Control System.
Nykyään valtuutetun varastonpitäjän, joka lähettää väliaikaisesti valmisteverottomia tuotteita toisiin jäsenmaihin, on varustettava tavarat hallinnollisella saateasiakirjalla (paperilomake). Saateasiakirja laaditaan neljänä kappaleena, joista yksi jää lähettäjälle, yhden saa vastaanottaja, yksi palautetaan lähettäjälle ja yksi kappale annetaan määrämaan viranomaisille, jos nämä sitä edellyttävät. Suomessa viimeksi mainitun kappaleen säilyttää viranomaisen sijasta vastaanottaja. Saateasiakirjan on ehdottomasti oltava väliaikaisesti valmisteverottomina siirrettävien tuotteiden mukana kuljetuksen aikana. (Katso Asiakastiedote 16, Valmisteverotus, pdf-tiedosto)
EU:n laajuinen EMCS-hanke koskee vain hallinnollisella saateasiakirjalla jäsenmaiden välillä toimitettavia valmisteveron alaisia tuotteita. Tietokoneistettu järjestelmä tulee siis kattamaan vain jäsenmaiden välillä tapahtuvat alkoholi- ja tupakkatuotteiden sekä energiatuotteiden väliaikaisesti valmisteverottomat siirrot sekä viennin ja tuonnin. Jo verotettujen tuotteiden siirrot, joissa käytetään yksinkertaistettua saateasiakirjaa, eivät siten kuulu hankkeeseen. Kansallista EMCS-järjestelmää voidaan myös hyödyntää Suomen sisäisissä siirroissa.
Jokaisessa jäsenvaltiossa kehitetään kansallisesti oman maan EMCS-sovellus, joka on yhteydessä toisiin jäsenmaihin
Euroopan komission ylläpitämän keskusverkkoalueen kautta.
Järjestelmä otetaan käyttöön vaiheittain. Tämänhetkisen aikataulun mukaisesti käyttöönotto alkaa 1.4. 2010, jolloin väliaikaisesti valmisteverottomia tuotteita vastaanottavien elinkeinoharjoittajien tulisi pystyä vastaanottamaan sähköinen e-AAD, joka lähetetään pilottiryhmän jäsenmaista. Vanha paperinen AAD on siinä vaiheessa vielä osittain käytössä. Vuoden 2010 lopusta alkaen tulisi kaikkien elinkeinoharjoittajien pystyä lähettämään ja vastaanottamaan mm. e-AAD ja sen kuittausviesti.
Yhteys järjestelmään tapahtuu Internet-käyttöliittymän kautta. Yritykset voivat myös vapaaehtoisesti rakentaa omasta järjestelmästään yhteyden EMCS-järjestelmään ja vaihtaa vaadittuja tietoja viestimuodossa kansallisen EMCS-järjestelmän kanssa.